31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0195 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
106 aa  206  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  37 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32.97 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  35.29 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  35.05 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  31.4 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  38.71 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  28.12 
 
 
109 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  28.12 
 
 
109 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  35.11 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  30.21 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  34.04 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  32.61 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  34.04 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  35.9 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  39.78 
 
 
106 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  35.44 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  35.96 
 
 
108 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  35.44 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  39.29 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  31.82 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>