27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1720 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  202  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  38.61 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  35.16 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  34.41 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  43.01 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  31.31 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  30.59 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  30.59 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  29.41 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  32.98 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  33.65 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  30.39 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  28.87 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  34.34 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  34.04 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  35.96 
 
 
106 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>