23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1929 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  44.71 
 
 
98 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  42.45 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  41.58 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  40.7 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  37.62 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  36 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  34.91 
 
 
109 aa  59.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  38.04 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  33.65 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  32.97 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  35 
 
 
111 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  33.01 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  25.49 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  30.61 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  29.9 
 
 
108 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0941  branched-chain amino acid transport protein AzlD  28.57 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  33 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  27.47 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>