37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0080 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  2e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 
132 aa  110  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.85786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  45.19 
 
 
130 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  45.8 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.27024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  43.85 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.50167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
125 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
131 aa  83.2  1e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  43.65 
 
 
136 aa  83.2  1e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  36.64 
 
 
141 aa  80.1  1e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  43.24 
 
 
123 aa  78.2  4e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  40.65 
 
 
130 aa  77.8  5e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  37.31 
 
 
137 aa  77.4  7e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
130 aa  72.8  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  35.61 
 
 
130 aa  70.5  7e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  70.5  7e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 
128 aa  68.6  3e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  39.6 
 
 
128 aa  67  8e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
142 aa  67  8e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  29.85 
 
 
134 aa  65.9  2e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
129 aa  65.5  2e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
152 aa  65.1  3e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  65.1  3e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
151 aa  63.9  6e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
131 aa  63.5  9e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  62.8  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  33.08 
 
 
135 aa  61.2  4e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
127 aa  61.2  5e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
133 aa  57.4  6e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
89 aa  55.8  2e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
131 aa  54.3  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  32.31 
 
 
137 aa  51.6  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0573  hypothetical protein  31.97 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  27.21 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  34 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  27.78 
 
 
131 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  26.98 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>