27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3373 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1079  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  46.07 
 
 
524 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  29.46 
 
 
496 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  31.36 
 
 
510 aa  164  4e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  28.65 
 
 
537 aa  120  4e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  27.57 
 
 
505 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  27.1 
 
 
544 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  29.33 
 
 
584 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  23.69 
 
 
530 aa  85.9  1e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  23.75 
 
 
456 aa  83.6  9e-15  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  29.29 
 
 
517 aa  80.1  8e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  24.27 
 
 
533 aa  78.6  2e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  27.71 
 
 
519 aa  76.6  9e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  27.71 
 
 
519 aa  76.6  9e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  23.9 
 
 
528 aa  73.2  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  24.56 
 
 
538 aa  73.2  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  25.61 
 
 
523 aa  72  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  26.43 
 
 
543 aa  72  3e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  26.43 
 
 
543 aa  72  3e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  29.7 
 
 
521 aa  71.2  4e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  22.99 
 
 
582 aa  70.5  7e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  26.48 
 
 
517 aa  68.9  2e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  23.35 
 
 
543 aa  68.2  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  23.36 
 
 
523 aa  67  8e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  23.91 
 
 
511 aa  65.1  3e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  24.02 
 
 
552 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3417  Mu-like protein prophage protein gp29-like protein  24.04 
 
 
545 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.610061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>