21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0008 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1051    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  25.43 
 
 
550 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  26.1 
 
 
550 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  25.9 
 
 
550 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  25.51 
 
 
589 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  28.14 
 
 
367 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6678  hypothetical protein  27.69 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000129285  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  21.85 
 
 
688 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  22.57 
 
 
563 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  26.33 
 
 
739 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  21.7 
 
 
730 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  33.72 
 
 
1787 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2071  hypothetical protein  38.03 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  37.38 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  23.83 
 
 
1850 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  28.05 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 
708 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  29.49 
 
 
706 aa  43.9  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 
667 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  29.49 
 
 
706 aa  43.9  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  26.56 
 
 
672 aa  43.5  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>