More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2965 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  87.84 
 
 		 370 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  100 
 
 		 370 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  86.76 
 
 		 370 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  86.76 
 
 		 370 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  86.76 
 
 		 370 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  86.76 
 
 		 370 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  91.89 
 
 		 370 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  87.3 
 
 		 370 aa  598  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  82.97 
 
 		 370 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  81.89 
 
 		 370 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  82.16 
 
 		 370 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  82.97 
 
 		 370 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  82.97 
 
 		 370 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  82.97 
 
 		 370 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  82.97 
 
 		 370 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  82.43 
 
 		 370 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  68.77 
 
 		 373 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  65.85 
 
 		 373 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  60.87 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  64.11 
 
 		 373 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  69.17 
 
 		 363 aa  465  9.999999999999999e-131  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  61.96 
 
 		 367 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  61.96 
 
 		 367 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  62.5 
 
 		 367 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  62.23 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  65.3 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  59.78 
 
 		 368 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  61.89 
 
 		 368 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  61.89 
 
 		 368 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  62.12 
 
 		 371 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  61.89 
 
 		 368 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  61.62 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  60.05 
 
 		 368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  60.87 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  61.68 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  59.51 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  58.84 
 
 		 371 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  60.33 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  58.24 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  57.58 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  59.78 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  55.06 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  51.97 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  53.76 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  54.93 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  53.26 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  56.02 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  52.88 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  52.25 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  52.6 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  56.42 
 
 		 376 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  53.15 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  51.77 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  54.35 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  56.34 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  52.99 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  53.42 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  53.8 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  53.42 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  52.1 
 
 		 380 aa  362  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  49.86 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  53.07 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  52.05 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  52.82 
 
 		 364 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  51.39 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  57.27 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  57.99 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  57.99 
 
 		 367 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  51.65 
 
 		 381 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  54.63 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  50.42 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01655  rod shape-determining protein RodA  62.3 
 
 		 253 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  52.51 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  52.34 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  47.25 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  47.75 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  47.46 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  50.28 
 
 		 370 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  47.55 
 
 		 360 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  48.9 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  47.71 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  47.71 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  48.9 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  46.63 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  49.18 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  52.07 
 
 		 380 aa  315  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  49.18 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  49.45 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  49.45 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  49.45 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  49.86 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  49.18 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  47.43 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  49.31 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>