225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0035 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0035  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 520 aa  1078    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.39 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.85 
 
 		 413 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  36.49 
 
 		 422 aa  250  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  37.67 
 
 		 414 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.48 
 
 		 427 aa  249  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.85 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  39.48 
 
 		 415 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  37.05 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.22 
 
 		 422 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.76 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.68 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  35.84 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.51 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  36.39 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.05 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.26 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  36.41 
 
 		 433 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.51 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  33.77 
 
 		 435 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.87 
 
 		 433 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  36.49 
 
 		 708 aa  225  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  37.54 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  36.73 
 
 		 420 aa  225  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  36.49 
 
 		 730 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.22 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  36.2 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.13 
 
 		 437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.91 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.58 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.04 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  36.04 
 
 		 730 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.32 
 
 		 436 aa  221  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.03 
 
 		 433 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.16 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.99 
 
 		 437 aa  217  5e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  35.2 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.11 
 
 		 393 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.66 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.95 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.71 
 
 		 440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  35.26 
 
 		 416 aa  214  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  34.95 
 
 		 473 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.96 
 
 		 374 aa  210  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  33.83 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  33.85 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.52 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  36.12 
 
 		 439 aa  205  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.64 
 
 		 385 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  35.62 
 
 		 439 aa  203  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.81 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.44 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  33.98 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.66 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 439 aa  195  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.61 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.61 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.67 
 
 		 365 aa  187  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.71 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.43 
 
 		 381 aa  187  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.51 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.96 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.51 
 
 		 454 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.93 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  33.51 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.26 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.26 
 
 		 402 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  35.29 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  33.13 
 
 		 349 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.14 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  33.95 
 
 		 347 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.2 
 
 		 347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  33.14 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.58 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.23 
 
 		 341 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  35.88 
 
 		 527 aa  163  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.63 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  33.43 
 
 		 344 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.46 
 
 		 356 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.41 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.82 
 
 		 347 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.16 
 
 		 350 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1350  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.65 
 
 		 594 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  33.02 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  33.11 
 
 		 363 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  31.48 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.21 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.92 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0411  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.93 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821427 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.33 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.38 
 
 		 356 aa  146  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.97 
 
 		 362 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  33.65 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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