More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1757 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  44.94 
 
 
266 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  41.88 
 
 
275 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  41.94 
 
 
265 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  39.42 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.13 
 
 
263 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.89 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  38.1 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  37.06 
 
 
282 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  50.32 
 
 
463 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  34.06 
 
 
266 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  47.02 
 
 
442 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  51.8 
 
 
856 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 
262 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.15 
 
 
266 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  33.12 
 
 
262 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  31.33 
 
 
262 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  32.48 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.91 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.31 
 
 
263 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  31.21 
 
 
260 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.66 
 
 
263 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  38.46 
 
 
441 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  32.06 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  31.65 
 
 
262 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  32.06 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.66 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  32.63 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.48 
 
 
261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.28 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  33.12 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.48 
 
 
261 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  32.59 
 
 
260 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.27 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  43.68 
 
 
417 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.06 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.06 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  53.19 
 
 
415 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.13 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  31.86 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  32.5 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  30.23 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  31.66 
 
 
264 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.43 
 
 
261 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  30.79 
 
 
294 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  32.09 
 
 
265 aa  126  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.73 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  33.76 
 
 
260 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.76 
 
 
294 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.38 
 
 
260 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  32.58 
 
 
260 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  47.92 
 
 
440 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  31.83 
 
 
260 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  31.83 
 
 
260 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.38 
 
 
260 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  31.97 
 
 
261 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  32.17 
 
 
261 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  31.01 
 
 
262 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.11 
 
 
260 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  31.23 
 
 
261 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.79 
 
 
262 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  48.59 
 
 
623 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.48 
 
 
264 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  48.59 
 
 
750 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.79 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  33.02 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.11 
 
 
261 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.19 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.86 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.85 
 
 
260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.52 
 
 
397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.37 
 
 
296 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  33.12 
 
 
260 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.47 
 
 
390 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  46.71 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.53 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.11 
 
 
260 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.35 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  32.46 
 
 
261 aa  119  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  32.59 
 
 
262 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4123  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.52 
 
 
329 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  48.23 
 
 
845 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 
262 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.97 
 
 
260 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  46.5 
 
 
475 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3280  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.95 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  32.28 
 
 
262 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  48.23 
 
 
838 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  32.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  32.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  48.23 
 
 
819 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  30.55 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  33.12 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.66 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.21 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  32.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  31.75 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  32.8 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  30.52 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>