132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5711 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  100 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  78.72 
 
 		 167 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  73.03 
 
 		 157 aa  223  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  74.81 
 
 		 168 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  74.81 
 
 		 168 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  71.43 
 
 		 178 aa  214  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  71.85 
 
 		 168 aa  213  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  73.33 
 
 		 168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  64.38 
 
 		 163 aa  207  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  65.31 
 
 		 153 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  62.42 
 
 		 158 aa  198  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  65.31 
 
 		 153 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  69.23 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  69.23 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  67.15 
 
 		 152 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  68.75 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  60.26 
 
 		 157 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  59.87 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  63.19 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  61.69 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  63.04 
 
 		 172 aa  190  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  68.5 
 
 		 154 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  59.48 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  65.94 
 
 		 160 aa  190  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  64.54 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  64.54 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  64.54 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  64.54 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  64.54 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  60.99 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  60.99 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  60.99 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  67.72 
 
 		 154 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  60.13 
 
 		 169 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  63.83 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  63.83 
 
 		 159 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  64.44 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  65.94 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  64.44 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  61.54 
 
 		 156 aa  185  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  61.11 
 
 		 159 aa  185  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  60.13 
 
 		 159 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  64.44 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  64.18 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  64.18 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  64.18 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  55.26 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  63.04 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  62.04 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  64.18 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  62.96 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  62.96 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  62.96 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  57.34 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  59.03 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  57.24 
 
 		 160 aa  180  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  60.87 
 
 		 158 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  53.74 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  59.12 
 
 		 158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  52.08 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  54.33 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  50.31 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  48.44 
 
 		 155 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  51.54 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  47.02 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  47.5 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  52.5 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  50.83 
 
 		 182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  50.83 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  44.81 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  43.95 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  47.77 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  44.06 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  48.33 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  47.69 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  47.5 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  46.67 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  41.61 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  46.28 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  47.5 
 
 		 180 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  41.33 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1836  CreA family protein  40.54 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  42.36 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  41.38 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  41.38 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2655  CreA family protein  39.6 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.546871  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2453  CreA family protein  39.1 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1735  CreA family protein  41.26 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1824  CreA family protein  39.86 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00367873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1872  CreA family protein  39.1 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>