127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0026 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  50.78 
 
 
179 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  44.06 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  48.09 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  43.84 
 
 
158 aa  123  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  44.27 
 
 
169 aa  123  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  40 
 
 
156 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  43.54 
 
 
164 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  41.83 
 
 
155 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  41.83 
 
 
155 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  41.83 
 
 
155 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  39.86 
 
 
157 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  37.75 
 
 
154 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  45.8 
 
 
172 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  45.8 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  40.38 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  43.65 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  37.75 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  42.06 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  42.06 
 
 
153 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  44 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  40.15 
 
 
153 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  39.73 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  46.09 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  46.09 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  39.42 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  46.09 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  41.5 
 
 
156 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  40.67 
 
 
160 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  41.27 
 
 
153 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  43.65 
 
 
161 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  43.2 
 
 
152 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  46.88 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  44.44 
 
 
161 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  40.74 
 
 
178 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  41.06 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  40.94 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  41.73 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  41.73 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  42.86 
 
 
168 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  44.44 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  42.45 
 
 
158 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  37.65 
 
 
161 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  41.27 
 
 
158 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  39.68 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  42.54 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  41.78 
 
 
169 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  42.11 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  42.11 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  42.11 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  42.11 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  42.11 
 
 
159 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  38.56 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  41.91 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  41.91 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  41.91 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  41.91 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  41.91 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  41.35 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  41.35 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  40.48 
 
 
167 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  36.36 
 
 
170 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  38.93 
 
 
156 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  39.68 
 
 
167 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  36.51 
 
 
155 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  38.82 
 
 
173 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  36.96 
 
 
181 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  37.68 
 
 
184 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  37.68 
 
 
184 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  37.33 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  35.17 
 
 
186 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  37.19 
 
 
182 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  35.07 
 
 
182 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  35.54 
 
 
180 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  35.54 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  34.59 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  36.36 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  33.12 
 
 
176 aa  87.8  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  35.54 
 
 
183 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  34.87 
 
 
187 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1788  CreA family protein  32.1 
 
 
165 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.804701  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  33.62 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1975  CreA family protein  35.9 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00187565  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0829  CreA family protein  28.4 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  0.0737603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1735  CreA family protein  33.62 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2098  CreA  32.76 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.409089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2415  CreA family protein  31.17 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113844  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1836  CreA family protein  32.76 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1824  CreA family protein  33.9 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00367873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>