More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2714 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.89 
 
 
559 aa  829    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.27 
 
 
553 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 
555 aa  1148    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.19 
 
 
554 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.56 
 
 
552 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  56.66 
 
 
562 aa  653    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.33 
 
 
552 aa  770    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.17 
 
 
557 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.21 
 
 
561 aa  724    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.47 
 
 
554 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.53 
 
 
558 aa  625  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.79 
 
 
565 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.08 
 
 
564 aa  624  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.6 
 
 
555 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.48 
 
 
557 aa  618  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.86 
 
 
563 aa  616  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.62 
 
 
582 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.48 
 
 
569 aa  610  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  54.3 
 
 
569 aa  611  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.94 
 
 
588 aa  609  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.48 
 
 
569 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.44 
 
 
563 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.57 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.21 
 
 
566 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.16 
 
 
569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.04 
 
 
566 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.4 
 
 
563 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.86 
 
 
566 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.29 
 
 
562 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.87 
 
 
573 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.75 
 
 
562 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.51 
 
 
571 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  50.89 
 
 
568 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.68 
 
 
564 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.68 
 
 
559 aa  589  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.7 
 
 
572 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.7 
 
 
572 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  51.41 
 
 
564 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  51.62 
 
 
578 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.07 
 
 
570 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.25 
 
 
570 aa  585  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.76 
 
 
558 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.53 
 
 
568 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  51.62 
 
 
577 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  50.97 
 
 
566 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.07 
 
 
570 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.53 
 
 
568 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.97 
 
 
566 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.62 
 
 
563 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.07 
 
 
570 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  53.41 
 
 
567 aa  585  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.33 
 
 
570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  50.98 
 
 
562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.6 
 
 
571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.96 
 
 
556 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.7 
 
 
571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.97 
 
 
571 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.51 
 
 
557 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.52 
 
 
555 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.08 
 
 
556 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.4 
 
 
581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.42 
 
 
563 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.4 
 
 
581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.9 
 
 
561 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.73 
 
 
566 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.2 
 
 
566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  50.98 
 
 
582 aa  571  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.01 
 
 
584 aa  569  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.02 
 
 
564 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.64 
 
 
568 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.29 
 
 
570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.53 
 
 
636 aa  560  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.42 
 
 
561 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  50.8 
 
 
560 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.89 
 
 
576 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.28 
 
 
581 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.2 
 
 
587 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  51.89 
 
 
569 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  47.7 
 
 
568 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.2 
 
 
587 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.25 
 
 
599 aa  558  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.28 
 
 
581 aa  557  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.91 
 
 
587 aa  555  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.18 
 
 
597 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.91 
 
 
573 aa  554  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  50.81 
 
 
581 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.66 
 
 
565 aa  553  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.31 
 
 
585 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  50.26 
 
 
589 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.95 
 
 
572 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2216  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.91 
 
 
557 aa  550  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.68 
 
 
567 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.67 
 
 
595 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.56 
 
 
558 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.58 
 
 
563 aa  551  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.74 
 
 
602 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.29 
 
 
582 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.54 
 
 
581 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.12 
 
 
593 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.4 
 
 
585 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>