More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1964 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0439  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.28 
 
 
508 aa  766  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.6667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0313  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  73.48 
 
 
508 aa  769  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0316  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  73.28 
 
 
508 aa  767  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0329  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.48 
 
 
508 aa  769  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  59.02 
 
 
510 aa  652  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.28 
 
 
509 aa  773  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0448  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  75.25 
 
 
509 aa  786  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2518  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.94 
 
 
509 aa  734  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
509 aa  1038  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0438  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.48 
 
 
508 aa  768  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.89 
 
 
508 aa  762  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0376  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.08 
 
 
508 aa  766  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0344  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  73.48 
 
 
508 aa  769  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0391  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.48 
 
 
508 aa  769  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4927  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  73.67 
 
 
508 aa  771  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640436  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  73.48 
 
 
508 aa  764  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0167284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0384  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  60.9 
 
 
508 aa  625  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0439  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  57.56 
 
 
507 aa  612  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00965821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0428  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  57.56 
 
 
507 aa  612  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.273089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.56 
 
 
523 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.67 
 
 
523 aa  605  1e-172  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.81 
 
 
520 aa  602  1e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.34 
 
 
523 aa  602  1e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.78 
 
 
525 aa  604  1e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.96 
 
 
507 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.8 
 
 
532 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  58.8 
 
 
521 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  60 
 
 
520 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.14 
 
 
519 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57 
 
 
530 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.69 
 
 
521 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.8 
 
 
523 aa  592  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.61 
 
 
532 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.75 
 
 
520 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3107  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  57.95 
 
 
520 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00119955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  57.64 
 
 
524 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  56.81 
 
 
530 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.914e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.23 
 
 
523 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0830  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.62 
 
 
522 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.84 
 
 
532 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.03 
 
 
521 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.03 
 
 
521 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0929  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.2 
 
 
522 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.81 
 
 
530 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.00097e-05  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.14 
 
 
518 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  4.20739e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.45 
 
 
533 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.45 
 
 
533 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4055  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.25 
 
 
524 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3942  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  57.25 
 
 
524 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.45 
 
 
533 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.84 
 
 
532 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.84 
 
 
532 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.05 
 
 
528 aa  582  1e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.45 
 
 
527 aa  582  1e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.86 
 
 
525 aa  582  1e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.61 
 
 
518 aa  582  1e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.91 
 
 
520 aa  583  1e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  55.92 
 
 
601 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.05 
 
 
528 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.53 
 
 
520 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.66 
 
 
525 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0688  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.59 
 
 
530 aa  581  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242332  normal  0.621191 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.23 
 
 
526 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  6.73423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.86 
 
 
528 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0747  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.81 
 
 
524 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.501154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.37 
 
 
529 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.86 
 
 
528 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.66 
 
 
525 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  58.72 
 
 
520 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  56.2 
 
 
535 aa  575  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  56.09 
 
 
622 aa  575  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  58.14 
 
 
520 aa  578  1e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.88 
 
 
521 aa  577  1e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.88 
 
 
518 aa  575  1e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00897132  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  56.59 
 
 
535 aa  575  1e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  57.48 
 
 
519 aa  578  1e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2368  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.07 
 
 
518 aa  576  1e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  57.56 
 
 
526 aa  575  1e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.45 
 
 
521 aa  573  1e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.36 
 
 
521 aa  572  1e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.65 
 
 
518 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.06 
 
 
525 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  56.56 
 
 
529 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  54.63 
 
 
522 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0259  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.3 
 
 
527 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00384538 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  55.02 
 
 
531 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1243  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.62 
 
 
517 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  55.41 
 
 
531 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.37 
 
 
520 aa  555  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.663768  normal  0.219895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3729  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  54.32 
 
 
520 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.73 
 
 
515 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  54.35 
 
 
521 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  54.35 
 
 
531 aa  555  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.97 
 
 
535 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.16 
 
 
535 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04590  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  55.9 
 
 
530 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  54.35 
 
 
531 aa  555  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  54.35 
 
 
531 aa  555  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  54.35 
 
 
531 aa  555  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  54.35 
 
 
531 aa  555  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>