More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1775 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  55.32 
 
 
236 aa  268  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  44.44 
 
 
241 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  41.74 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  41.85 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  39.06 
 
 
234 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  34.75 
 
 
235 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  39.06 
 
 
234 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0445  peptidase M22 glycoprotease  37.93 
 
 
221 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  35.47 
 
 
236 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  38.43 
 
 
250 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  33.77 
 
 
230 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  33.77 
 
 
230 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
230 aa  148  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  33.77 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  35.53 
 
 
246 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  34.6 
 
 
241 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
230 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 
238 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  35.86 
 
 
229 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  37.17 
 
 
230 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  32.74 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1098  peptidase M22 glycoprotease  32.47 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  32.34 
 
 
239 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1493  peptidase M22 glycoprotease  35.11 
 
 
230 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0479198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2748  peptidase M22 glycoprotease  35.56 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2716  peptidase M22 glycoprotease  33.91 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  36 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  33.91 
 
 
227 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  36 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  32.74 
 
 
240 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  34.22 
 
 
230 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  29.87 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  34.87 
 
 
241 aa  118  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  33.33 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0618  peptidase M22 glycoprotease  31.14 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  31.58 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  32.9 
 
 
241 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  34.2 
 
 
228 aa  108  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  32.74 
 
 
228 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  30.32 
 
 
225 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  28.19 
 
 
226 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  32.62 
 
 
231 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  34.88 
 
 
220 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  34.88 
 
 
220 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1778  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  31.14 
 
 
236 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  31.15 
 
 
230 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.35 
 
 
456 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  30.74 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  30.63 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  36.09 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  30.77 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0074  peptidase M22 glycoprotease  28.95 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
456 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  29.91 
 
 
235 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  30.3 
 
 
228 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  29.91 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.68 
 
 
456 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0964  peptidase M22 glycoprotease  25.83 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0778  hypothetical protein  30.36 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  25.99 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  28.32 
 
 
236 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  30.77 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  28.95 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5298  peptidase M22 glycoprotease  27.44 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.355129  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  32.65 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  31.64 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1401  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  30.13 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  32.75 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  28.64 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  28.39 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  28.39 
 
 
229 aa  85.5  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  30.34 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  29.96 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  29.96 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  29.46 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.44 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.44 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.44 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0123  peptidase M22 glycoprotease  31.54 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000799659  hitchhiker  0.00871269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  39.68 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  28.18 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  29.44 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1251  peptidase M22 glycoprotease  30.38 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0110331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  38.89 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  38.89 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  35.82 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  35.82 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  35.82 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  35.82 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  30.37 
 
 
223 aa  82  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  35.82 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>