56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1113 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  100 
 
 
284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  39.23 
 
 
269 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  37.35 
 
 
273 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  36.15 
 
 
274 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  38.78 
 
 
269 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  37.98 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  40.15 
 
 
278 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  37.07 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  34.83 
 
 
278 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  35.14 
 
 
275 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  38.22 
 
 
281 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  34.34 
 
 
297 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  36.05 
 
 
274 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  36.88 
 
 
280 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  33.99 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  33.99 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  34.33 
 
 
287 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  33.96 
 
 
287 aa  161  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  32.23 
 
 
294 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  35 
 
 
288 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  34.89 
 
 
279 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  38.55 
 
 
293 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  29.74 
 
 
284 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  34.83 
 
 
327 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  35.14 
 
 
289 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  32.14 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  31.32 
 
 
291 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  33.08 
 
 
328 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  30.48 
 
 
289 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  30.94 
 
 
611 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  36.29 
 
 
458 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  25.94 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  27.38 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  31.52 
 
 
323 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  25.91 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  31.18 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  27.52 
 
 
418 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  29.55 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  27.5 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  29.55 
 
 
587 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  33.78 
 
 
559 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  26.56 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  27.35 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  25.84 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  24.07 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  30 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  28.47 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  27.61 
 
 
348 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  28.24 
 
 
206 aa  45.8  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  25 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  23.21 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  22.29 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  24.54 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  29.1 
 
 
338 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  29.1 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  24.54 
 
 
232 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>