More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0450 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  76.79 
 
 		 154 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  73.39 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  72.97 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  51.87 
 
 		 188 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.6 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  47.87 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  46.81 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.6 
 
 		 159 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  50.27 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  60.26 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  50.79 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  60.26 
 
 		 236 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  60.26 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  60.26 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  50.59 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  63.56 
 
 		 163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  50.54 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  60.26 
 
 		 236 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  49.74 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  51.09 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  61.9 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  47.2 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  69.09 
 
 		 172 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  65.04 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  56.21 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  66.1 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  66.1 
 
 		 168 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  50.53 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  67.89 
 
 		 160 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 186 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  47.94 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  68.75 
 
 		 231 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  51.69 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  67.86 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  64.35 
 
 		 165 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  64.35 
 
 		 165 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  48.17 
 
 		 162 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  66.98 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  48.19 
 
 		 160 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  49.47 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  67.57 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  68.87 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 200 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 170 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  54.12 
 
 		 233 aa  160  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  44.74 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  51.89 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  47.94 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  48.91 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  50.52 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  45.18 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  59.57 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  47.59 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  63.06 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  63.06 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  63.06 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  63.06 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  66.04 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  46.11 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  47.92 
 
 		 165 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  60.66 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  42.93 
 
 		 152 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  59.5 
 
 		 159 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  61.34 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  62.96 
 
 		 230 aa  155  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  49.48 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  46.63 
 
 		 168 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  47.92 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  62.26 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>