32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4730 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  100 
 
 		 321 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  36.16 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  39.47 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  36.56 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  35.6 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  36.08 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  33.63 
 
 		 344 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  36.24 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  27.65 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  28.48 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  25.87 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  28.28 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  25.89 
 
 		 751 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  23.31 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  30.9 
 
 		 359 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.25 
 
 		 769 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 750 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.37 
 
 		 755 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.49 
 
 		 751 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  24.38 
 
 		 745 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  24.82 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.21 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  23.53 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  23.49 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  26.88 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  23.69 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  29.2 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  20.07 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  20.07 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  20.07 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>