More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2784 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.28 
 
 
195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
194 aa  235  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  235  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.03 
 
 
195 aa  232  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.99 
 
 
195 aa  232  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  227  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.61 
 
 
196 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
200 aa  225  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
200 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
197 aa  224  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  222  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
196 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
202 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
195 aa  222  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
199 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
195 aa  222  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.31 
 
 
197 aa  221  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  221  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
196 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
198 aa  221  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
198 aa  220  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
196 aa  219  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.4 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.37 
 
 
195 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.17 
 
 
195 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
201 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
208 aa  217  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  217  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.17 
 
 
195 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  216  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
199 aa  216  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
201 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.69 
 
 
195 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.85 
 
 
194 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.17 
 
 
197 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.33 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.76 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.04 
 
 
201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0092  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.69 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.37 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1918  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.63685  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0188  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
206 aa  212  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3025  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  0.0729461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1476  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
194 aa  210  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.73 
 
 
197 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02210  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.12 
 
 
197 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0377  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
200 aa  209  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
207 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.21 
 
 
197 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
209 aa  208  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.69 
 
 
197 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.12 
 
 
197 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0126  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.65 
 
 
197 aa  207  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
198 aa  207  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1553  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  207  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
209 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
197 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
202 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.36 
 
 
194 aa  205  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1333  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.89 
 
 
191 aa  204  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000182342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
202 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5728  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.98 
 
 
196 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1820  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  53.37 
 
 
378 aa  203  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.31 
 
 
194 aa  202  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
202 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1310  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.81 
 
 
191 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
202 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
205 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  201  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
206 aa  201  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.12 
 
 
197 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1527  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1292  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.43 
 
 
194 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.83 
 
 
194 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>