258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2015 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.13209e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  95.35 
 
 
86 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  95.35 
 
 
89 aa  167  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  90.7 
 
 
86 aa  162  1e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  92.77 
 
 
84 aa  158  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  87.21 
 
 
86 aa  157  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  84.88 
 
 
86 aa  153  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.85 
 
 
96 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  58.9 
 
 
86 aa  97.1  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.89 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.16 
 
 
74 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.4465e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.35 
 
 
88 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.79 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.38 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  50.68 
 
 
73 aa  82.8  1e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.95477e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  52.05 
 
 
74 aa  82.8  1e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.68 
 
 
73 aa  81.3  4e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.31696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.05 
 
 
73 aa  81.3  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  51.35 
 
 
103 aa  80.9  5e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.05 
 
 
73 aa  80.1  9e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  49.32 
 
 
73 aa  80.1  9e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  46.58 
 
 
76 aa  79.7  1e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  50.68 
 
 
74 aa  79.7  1e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  52.86 
 
 
80 aa  79  2e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  50.68 
 
 
74 aa  78.6  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.01792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 
80 aa  78.6  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  43.75 
 
 
80 aa  78.6  3e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.11 
 
 
87 aa  77.4  6e-14  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  45.95 
 
 
80 aa  77  7e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  52.56 
 
 
173 aa  76.6  9e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.32 
 
 
72 aa  77  9e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.13557e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.05 
 
 
79 aa  76.6  1e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.61 
 
 
73 aa  75.9  2e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.11 
 
 
79 aa  75.1  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
289 aa  75.1  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.7 
 
 
76 aa  75.5  3e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.11 
 
 
79 aa  75.1  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
79 aa  75.1  3e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
289 aa  74.7  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  46.15 
 
 
78 aa  74.3  5e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  52.78 
 
 
311 aa  73.9  7e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  50.7 
 
 
76 aa  72.8  2e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
78 aa  72.8  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  47.89 
 
 
81 aa  72  3e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  49.3 
 
 
80 aa  72  3e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.58 
 
 
73 aa  72  3e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  44.74 
 
 
79 aa  72  3e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.52 
 
 
77 aa  71.6  3e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  1.33842e-14 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  49.32 
 
 
75 aa  71.2  4e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.95 
 
 
73 aa  70.9  5e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 
81 aa  70.9  5e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  47.3 
 
 
74 aa  70.9  6e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.78833e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  43.02 
 
 
79 aa  70.9  6e-12  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 
309 aa  70.1  9e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
72 aa  70.1  9e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  46.48 
 
 
76 aa  69.3  1e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  50 
 
 
213 aa  68.9  2e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  43.37 
 
 
81 aa  69.3  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  53.23 
 
 
75 aa  68.6  2e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.33 
 
 
78 aa  68.6  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  52.05 
 
 
158 aa  68.2  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  46.58 
 
 
296 aa  68.6  3e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 
74 aa  68.6  3e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  44.93 
 
 
81 aa  68.6  3e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.58 
 
 
301 aa  68.2  4e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.67 
 
 
78 aa  68.2  4e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  45.59 
 
 
81 aa  68.2  4e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  50 
 
 
75 aa  67.4  6e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.75361e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  43.37 
 
 
81 aa  67  8e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  43.37 
 
 
81 aa  67  8e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  45.21 
 
 
72 aa  67  8e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.10342e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  43.37 
 
 
81 aa  67  8e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  43.37 
 
 
81 aa  66.2  1e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  42.03 
 
 
81 aa  66.2  2e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 
294 aa  65.1  3e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 
294 aa  65.1  3e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  47.14 
 
 
294 aa  65.1  3e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  44.59 
 
 
75 aa  64.7  4e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  42.65 
 
 
81 aa  64.7  4e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  45.21 
 
 
270 aa  64.7  4e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  42.65 
 
 
81 aa  64.7  4e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.54 
 
 
290 aa  64.3  5e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  44.44 
 
 
225 aa  63.5  8e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  40.54 
 
 
289 aa  62.8  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 
286 aa  62  2e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  40 
 
 
187 aa  61.6  4e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.84 
 
 
81 aa  60.5  8e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  48.48 
 
 
188 aa  59.7  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  1.81724e-05 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  48 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.23 
 
 
78 aa  59.7  1e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  48.57 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.86996e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>