More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0140 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  89.51 
 
 		 471 aa  855    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  64.74 
 
 		 468 aa  637    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  87.12 
 
 		 466 aa  845    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  83.58 
 
 		 469 aa  803    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 470 aa  969    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  64.96 
 
 		 468 aa  635    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  64.74 
 
 		 468 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  63.19 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  58.1 
 
 		 476 aa  551  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  53.86 
 
 		 475 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  53.86 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  55.48 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  54.88 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  52.83 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  54.68 
 
 		 475 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  51.62 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  52.93 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  52.27 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  52.7 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 505 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  52.7 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  53.1 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  52.89 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  52.6 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  51.97 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  51.17 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  51.62 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  52.28 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  51.52 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  52.17 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  51.29 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  51.72 
 
 		 474 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  49.89 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  51.85 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  52.52 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  51.41 
 
 		 474 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  51.63 
 
 		 481 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  52.81 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  52.07 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  50.75 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 475 aa  476  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  50.21 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  51.08 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  51.08 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  52.29 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  51.08 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  52.78 
 
 		 479 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  51.95 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  51.97 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  48.93 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  50.86 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  51.07 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  51.07 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  51.07 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  51.07 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  50.86 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  51.07 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  47.97 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  51.3 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  47.97 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  47.97 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  47.97 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  49.36 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  49.79 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>