More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2522 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  100 
 
 
336 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  52.6 
 
 
335 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  51.86 
 
 
328 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  51.37 
 
 
342 aa  359  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 
341 aa  342  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
341 aa  340  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  44.41 
 
 
333 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  44.55 
 
 
333 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  46.53 
 
 
334 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  42.9 
 
 
336 aa  315  7e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  44.89 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
334 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  44.58 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  46.22 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 
337 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
330 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  45.62 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  45.76 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
337 aa  308  8e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  48.24 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
321 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
318 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  45.65 
 
 
317 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  42.06 
 
 
324 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  51.35 
 
 
276 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  49.81 
 
 
285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  43.65 
 
 
326 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  50.8 
 
 
262 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  41.43 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  49.8 
 
 
292 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  54.32 
 
 
265 aa  281  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  44.6 
 
 
318 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
322 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  41.3 
 
 
329 aa  275  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  43.06 
 
 
323 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  37.42 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.51 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  50.57 
 
 
261 aa  267  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  38.82 
 
 
337 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  53.55 
 
 
254 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  40.31 
 
 
328 aa  262  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  38.72 
 
 
329 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  38.72 
 
 
329 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  40.44 
 
 
326 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 
338 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
329 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.14 
 
 
341 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
333 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 
334 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
334 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  41.21 
 
 
324 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  37.35 
 
 
324 aa  255  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  35.74 
 
 
334 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  37.2 
 
 
328 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  37.35 
 
 
328 aa  252  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  39.18 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  37.69 
 
 
326 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  36.73 
 
 
324 aa  249  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  35.95 
 
 
336 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  37.23 
 
 
330 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  39.37 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  36.17 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  39.02 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
323 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  34.36 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  36.22 
 
 
325 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  34.64 
 
 
332 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  34.04 
 
 
333 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  36.88 
 
 
329 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  33.44 
 
 
331 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 
343 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  36.56 
 
 
331 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  33.75 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  33.44 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  33.96 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  35.65 
 
 
331 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
314 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  37.61 
 
 
302 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.4 
 
 
243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.62 
 
 
328 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  33.67 
 
 
303 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.98 
 
 
243 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.16 
 
 
241 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
266 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 
317 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.02 
 
 
305 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  35.56 
 
 
260 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.49 
 
 
305 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.62 
 
 
316 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>