56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1301 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  46.79 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  41.03 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  39.32 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  39.32 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  39.32 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  32.2 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  29.41 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  31.58 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  29.41 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  29.06 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  28.57 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  28.57 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  27.73 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  27.73 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  25.64 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  28.18 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  28.45 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  22.22 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  30.7 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  30.7 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  25.64 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  28.81 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  26.96 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  28.81 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  27.19 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  17.12 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  27.97 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  26.05 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  37.25 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  28.57 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  25.22 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  27.5 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  25.47 
 
 		 126 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  27.03 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  35.29 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  25.23 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  24.32 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  21.19 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>