34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0633 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0633  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000160183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2469  hypothetical protein  49.61 
 
 		 284 aa  238  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0240538 
 
 
-
 
NC_002936  DET1143  hypothetical protein  37.16 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_961  hypothetical protein  37.82 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0043963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0972  membrane protein-like protein  36.79 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000387152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0220  hypothetical protein  30.32 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0226  hypothetical protein  30.32 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2198  hypothetical protein  30.69 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04240  predicted membrane protein  32.27 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4306  hypothetical protein  30.26 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0689253  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  25.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  31.01 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  31.88 
 
 		 406 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  28.41 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  27.8 
 
 		 442 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  27.49 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  28.05 
 
 		 442 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  37.65 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  28.78 
 
 		 338 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  28.38 
 
 		 399 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  28.82 
 
 		 397 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0307  FHA domain-containing protein  30.3 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  29.01 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  28.29 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  27.16 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  29.53 
 
 		 234 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  25.99 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  25.55 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  26.39 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  24.65 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  32.2 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  25.6 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  28.23 
 
 		 492 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>