More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0222 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  56.41 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  47.97 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  46.03 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  46.4 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  46.4 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  48.39 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  40.8 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  40.8 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  51.61 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  45.97 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  39.83 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  33.9 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  38.79 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  44.3 
 
 		 477 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  44.3 
 
 		 477 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  44.3 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  45.68 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 477 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  43.9 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.11 
 
 		 490 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 477 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 477 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 477 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  43.42 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  42.7 
 
 		 463 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  31.97 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 477 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  31.78 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  29.82 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.45 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  43.04 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  42.65 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 321 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  36.49 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 547 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>