27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0029 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0029  putative GAF sensor protein  100 
 
 
499 aa  983  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2360  PAS domain-containing protein  34.06 
 
 
411 aa  130  4e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2481  PAS domain-containing protein  32.5 
 
 
332 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.11 
 
 
494 aa  60.1  9e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  37.11 
 
 
494 aa  59.7  1e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  37.11 
 
 
494 aa  59.7  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.92 
 
 
516 aa  57.4  6e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
702 aa  56.6  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
357 aa  55.8  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.17968e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
373 aa  53.9  7e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1849  putative phytochrome sensor protein  28.48 
 
 
359 aa  51.6  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
958 aa  51.2  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.02 
 
 
777 aa  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
880 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  32.1 
 
 
554 aa  47.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 
553 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
604 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  38.37 
 
 
1301 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3185  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.88 
 
 
482 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2248  putative GAF sensor protein  27.68 
 
 
182 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.19 
 
 
516 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3932  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.44 
 
 
1135 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.36 
 
 
586 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  41.27 
 
 
508 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.62 
 
 
1785 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.07 
 
 
719 aa  43.5  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57603e-07 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.16 
 
 
362 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>