14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2481 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2481  PAS domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2360  PAS domain-containing protein  87.46 
 
 		 411 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0029  putative GAF sensor protein  32.14 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.43 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.25 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  29.66 
 
 		 900 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 900 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  26.8 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0378  sensory box protein  35.71 
 
 		 1491 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0214422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1795  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.04 
 
 		 714 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0771751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.98 
 
 		 1138 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  36.36 
 
 		 508 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 224 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>