More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5124 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  76.49 
 
 		 517 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  77.62 
 
 		 505 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  100 
 
 		 506 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  66 
 
 		 498 aa  650    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  75.45 
 
 		 505 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  76.69 
 
 		 510 aa  786    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  76.44 
 
 		 510 aa  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  62.38 
 
 		 504 aa  636    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  62.62 
 
 		 505 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  76.24 
 
 		 510 aa  805    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  65.88 
 
 		 504 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  75.45 
 
 		 505 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  81.78 
 
 		 505 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  82.14 
 
 		 505 aa  837    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  76.24 
 
 		 510 aa  805    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  77.43 
 
 		 505 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  75.64 
 
 		 505 aa  781    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  83.9 
 
 		 505 aa  869    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  64.88 
 
 		 507 aa  665    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  63.27 
 
 		 506 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  63.42 
 
 		 504 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  60.44 
 
 		 505 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  64.3 
 
 		 504 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  63.22 
 
 		 504 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  59.84 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  59.05 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  63.1 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  63.02 
 
 		 499 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  59.2 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  59.6 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  60.64 
 
 		 498 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  61.35 
 
 		 499 aa  611  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  62.4 
 
 		 510 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  59.84 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  62.08 
 
 		 503 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  63 
 
 		 496 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  60.12 
 
 		 500 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  61.77 
 
 		 502 aa  591  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  61.03 
 
 		 499 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  58.85 
 
 		 499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  59.84 
 
 		 509 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  61.33 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  59.8 
 
 		 497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  58.25 
 
 		 504 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  60.44 
 
 		 501 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  58.2 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  60.04 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.4 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.04 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.62 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  56.15 
 
 		 497 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  59.44 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.62 
 
 		 496 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  57.11 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  58.25 
 
 		 507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  55.67 
 
 		 498 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  59.24 
 
 		 500 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  54.3 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  57.06 
 
 		 507 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  58.2 
 
 		 507 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  54.09 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  53.35 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  56.91 
 
 		 522 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  56.8 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.82 
 
 		 501 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  51.57 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  51.49 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  52.61 
 
 		 494 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  55.49 
 
 		 502 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  51.2 
 
 		 498 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  51.2 
 
 		 498 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  51.79 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  53.6 
 
 		 520 aa  524  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  54.11 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  51.79 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  52.23 
 
 		 498 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.91 
 
 		 505 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  52.29 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  52 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  51.41 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  51.2 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  53.4 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  51.9 
 
 		 489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.18 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  52 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  51.2 
 
 		 496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  51.8 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.36 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  53.21 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  52.71 
 
 		 523 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  51.8 
 
 		 503 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  51.39 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  51.39 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  51.89 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  51.89 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  51.39 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  51.8 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  51.8 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  52.73 
 
 		 496 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  51.8 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>