16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3514 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  100 
 
 
329 aa  651  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  61.72 
 
 
302 aa  352  5e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  54.74 
 
 
384 aa  312  6e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  36.61 
 
 
659 aa  111  1e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  34.32 
 
 
575 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33 
 
 
575 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  34.13 
 
 
665 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.59 
 
 
572 aa  85.5  1e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  30.64 
 
 
516 aa  84  4e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  29.72 
 
 
591 aa  82  1e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  27.17 
 
 
655 aa  75.5  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  28.92 
 
 
591 aa  74.7  2e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  34.33 
 
 
526 aa  68.6  1e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  27.84 
 
 
518 aa  58.9  1e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.78669e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.29 
 
 
541 aa  56.6  5e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  32.37 
 
 
530 aa  55.8  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>