40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1781 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  32.82 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  31.79 
 
 		 240 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  32.31 
 
 		 240 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  31.79 
 
 		 240 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  32.31 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  32.31 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  31.79 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  32.31 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  32.31 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  31.79 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  31.79 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  29.05 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  35.81 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  32.88 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  32.88 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  26.13 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  31.79 
 
 		 758 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  33.09 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  32.88 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  30.82 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  28.78 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  34.03 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  29.61 
 
 		 727 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  27.78 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  27.91 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  32.5 
 
 		 641 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  28.57 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  26.15 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  28.26 
 
 		 726 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  29.27 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  24.31 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  32.21 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  25.82 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  24.88 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  24.88 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  28.57 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  27.22 
 
 		 448 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  28.12 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>