47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2407 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  100 
 
 		 357 aa  737    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  35.34 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  30.92 
 
 		 539 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  32.28 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  38.38 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  34.51 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  32.88 
 
 		 727 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  34.09 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  29.94 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  29.94 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  29.94 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  28.74 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  29.94 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  29.94 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  29.34 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  31.3 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  32.88 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  28.74 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  29.34 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  29.92 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  28.74 
 
 		 240 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  24.52 
 
 		 726 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  32.84 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  32.85 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  25.1 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  32.28 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  31.21 
 
 		 758 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  31.48 
 
 		 240 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  29.5 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  30.21 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  29.68 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  29.83 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  31.06 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  31.25 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  27.39 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  24.91 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  27.86 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  27.86 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1579  lipase class 3  29.95 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6230  lipase class 3  23.66 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7157  lipase class 3  25.33 
 
 		 291 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  30.36 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  27.72 
 
 		 694 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  26.12 
 
 		 596 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0004  triacylglycerol lipase  37.04 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  34.78 
 
 		 641 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>