27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01560 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  100 
 
 
262 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  53.21 
 
 
261 aa  281  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  49.43 
 
 
271 aa  274  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  49.04 
 
 
276 aa  272  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  50.47 
 
 
216 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  24.64 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  31.19 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  29.22 
 
 
384 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  24.31 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  24.23 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  29.71 
 
 
448 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  26.19 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  27.56 
 
 
381 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  27.56 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  27.56 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  27.33 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  26.71 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  26.71 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  26.71 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  26.71 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  26.71 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  26.92 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5847  lipase class 3  28.15 
 
 
383 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29272  predicted protein  44.44 
 
 
550 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  33.03 
 
 
405 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  26.75 
 
 
258 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  26.28 
 
 
240 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>