28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5346 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  100 
 
 		 343 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2321  lipase class 3  26.18 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5954  lipase class 3  29.65 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489511  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  26.21 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2073  putative lipase  31.25 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  27.56 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  27.56 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2014  putative lipase  28.75 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  27.56 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  27.56 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  27.56 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  27.56 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  27.56 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  27.48 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  25.82 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  27.11 
 
 		 240 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  29.17 
 
 		 258 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  26.67 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  37.04 
 
 		 539 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6262  lipase, class 3  33.91 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  32.26 
 
 		 384 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3825  hypothetical protein  22.39 
 
 		 561 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  25.69 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  29.41 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.4 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5957  lipase class 3  33.04 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  34.18 
 
 		 727 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  28.57 
 
 		 758 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>