127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0980 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 789 aa  1649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  60.91 
 
 		 788 aa  1013    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  41.7 
 
 		 778 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  39.2 
 
 		 780 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  38.14 
 
 		 781 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  36.11 
 
 		 780 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  37.96 
 
 		 778 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  35.47 
 
 		 795 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  35.79 
 
 		 795 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  35.39 
 
 		 795 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  35.13 
 
 		 790 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  34.87 
 
 		 790 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  33.54 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  34.86 
 
 		 807 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  33.29 
 
 		 825 aa  458  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  33.85 
 
 		 848 aa  456  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  34.05 
 
 		 858 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.46 
 
 		 787 aa  438  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  31.7 
 
 		 843 aa  425  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  33.03 
 
 		 784 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  32.77 
 
 		 784 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  32.37 
 
 		 824 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  32.5 
 
 		 791 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  32.33 
 
 		 800 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  32.28 
 
 		 786 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.82 
 
 		 810 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.65 
 
 		 786 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  32.37 
 
 		 791 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  43.8 
 
 		 767 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  34.62 
 
 		 786 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  30.82 
 
 		 986 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  32.02 
 
 		 794 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  32.6 
 
 		 789 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  33.88 
 
 		 781 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  31.09 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  31.09 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  29.56 
 
 		 780 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  31.87 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  30.63 
 
 		 790 aa  379  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  29.82 
 
 		 780 aa  353  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.43 
 
 		 782 aa  351  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  31.24 
 
 		 763 aa  346  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  28.66 
 
 		 755 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.53 
 
 		 771 aa  320  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.81 
 
 		 778 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.41 
 
 		 775 aa  310  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  29.64 
 
 		 750 aa  306  8.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.52 
 
 		 774 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  28.22 
 
 		 767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  27.35 
 
 		 805 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  28.59 
 
 		 710 aa  299  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  29.99 
 
 		 765 aa  292  2e-77  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  29.97 
 
 		 748 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.34 
 
 		 777 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  25.88 
 
 		 789 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.64 
 
 		 768 aa  283  9e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  27.9 
 
 		 751 aa  283  9e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  29.55 
 
 		 752 aa  283  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  26.99 
 
 		 807 aa  283  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  26.4 
 
 		 794 aa  279  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  26.24 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  26.94 
 
 		 787 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  27.53 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  28.73 
 
 		 757 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.7 
 
 		 759 aa  275  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  27.69 
 
 		 755 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  27.69 
 
 		 755 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  27.39 
 
 		 758 aa  270  7e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  29.34 
 
 		 752 aa  270  7e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  27.55 
 
 		 755 aa  270  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.55 
 
 		 755 aa  269  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.55 
 
 		 755 aa  269  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.55 
 
 		 755 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.28 
 
 		 755 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  26.72 
 
 		 761 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  27.52 
 
 		 755 aa  265  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  27.76 
 
 		 965 aa  264  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  32.24 
 
 		 760 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.59 
 
 		 749 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  27.56 
 
 		 759 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  28.23 
 
 		 769 aa  263  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  26.59 
 
 		 761 aa  259  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  26.8 
 
 		 978 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.65 
 
 		 762 aa  241  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.96 
 
 		 777 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.51 
 
 		 1053 aa  238  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  24.78 
 
 		 776 aa  238  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.08 
 
 		 1052 aa  235  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.49 
 
 		 1050 aa  234  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  26.87 
 
 		 753 aa  233  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.2 
 
 		 1053 aa  232  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.22 
 
 		 1051 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  25.89 
 
 		 720 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  28.01 
 
 		 748 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.11 
 
 		 1055 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.91 
 
 		 807 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.22 
 
 		 1051 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.03 
 
 		 807 aa  218  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>