195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0234 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
256 aa  477  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  74.62 
 
 
130 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  48.05 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  43.01 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  36.54 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  29.69 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  35.19 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  37.63 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  29.87 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  26.64 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  25.26 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  25.26 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.74 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  25.26 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  30.69 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  24.74 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  27.27 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  27.27 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  43.21 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  27.62 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  29.78 
 
 
399 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  30.4 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.53 
 
 
313 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  37.63 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  37.04 
 
 
453 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0331  Abortive infection protein  37.76 
 
 
262 aa  62  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0520111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  27.95 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  38.27 
 
 
527 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  38.27 
 
 
527 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.53 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.53 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  29.77 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30.53 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  42.86 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  32.94 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.01 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  30.86 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  29.01 
 
 
337 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  26.97 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  31.48 
 
 
249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  29.01 
 
 
337 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  25.28 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1263  abortive infection protein  26.85 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.568242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  29.66 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1192  abortive infection protein  25.5 
 
 
206 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0143958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  29.01 
 
 
337 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  25.32 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  36.49 
 
 
453 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  37.17 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  29.77 
 
 
337 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  34.36 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  27.7 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  38.27 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  32.77 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  30.53 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  27.88 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  28.57 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5083  CAAX amino terminal protease family protein  28.74 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  28.97 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  33.74 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5091  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  39.44 
 
 
453 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  32.71 
 
 
480 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  27.09 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  33.71 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  39.77 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5183  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 
203 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  25.78 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4818  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 
225 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  33.33 
 
 
528 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  30.38 
 
 
420 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  32.95 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  33.33 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4711  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0300594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4675  CAAX amino protease  27.61 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  31.76 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1896  abortive infection protein  37.36 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692997  normal  0.154839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.53 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5145  CAAX amino terminal protease family protein  43.68 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  31.45 
 
 
333 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4727  CAAX amino terminal protease family protein  38.71 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.972237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  31 
 
 
521 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  32.56 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  38.64 
 
 
227 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  34.94 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5053  CAAX amino terminal protease family protein  26.54 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  27.74 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  32.43 
 
 
452 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10671  integral membrane protein  30.26 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  27.74 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  34.15 
 
 
448 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>