58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1887 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  99.47 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  30.64 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  30.54 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 472 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  42.5 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  41.25 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  41.25 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3321  hypothetical protein  27.06 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.669546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  23.03 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  26.36 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3351  hypothetical protein  26.32 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3091  hypothetical protein  26.32 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3105  hypothetical protein  26.32 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  22.37 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  21.08 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  23.08 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  20.97 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  23.86 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  22.93 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4216  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141181  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  21.52 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  24.42 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  23.86 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  20.89 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  21.88 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 117 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  18.75 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  27.71 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1346  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase D-component  34.65 
 
 		 372 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.120946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3541  hypothetical protein  18.95 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0785  ArsR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2591  putative transcriptional regulator  23.42 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  27.17 
 
 		 125 aa  41.2  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 133 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>