30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0785 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0785  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  332  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2846  transcriptional regulator, ArsR family  31.21 
 
 
184 aa  107  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2991  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
184 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  35.9 
 
 
149 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  35.9 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  30 
 
 
107 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
208 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
98 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  37.18 
 
 
102 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  29.09 
 
 
107 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
87 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
96 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  29.07 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  29.07 
 
 
188 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
99 aa  40.8  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27.27 
 
 
108 aa  40.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>