228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1539 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
165 aa  325  1e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  81.21 
 
 
165 aa  278  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1664  putative nucleotide-binding protein  73.94 
 
 
165 aa  245  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1551  putative nucleotide-binding protein  59.39 
 
 
163 aa  194  5e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0423  putative nucleotide-binding protein  61.21 
 
 
163 aa  191  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1583  putative nucleotide-binding protein  61.21 
 
 
163 aa  191  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0398  putative nucleotide-binding protein  60.61 
 
 
163 aa  190  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.167613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0092  protein of unknown function DUF520  50.3 
 
 
165 aa  170  7e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0039  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
165 aa  163  1e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  43.03 
 
 
164 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  4.70515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  134  6e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  133  1e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  133  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  4e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  4e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  3.04548e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
163 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  130  1e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
166 aa  129  1e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  40.37 
 
 
164 aa  129  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
163 aa  129  2e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
162 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
161 aa  126  1e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  125  2e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  5.36011e-05 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  125  2e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  126  2e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  40 
 
 
165 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.72661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
162 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
160 aa  124  4e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  124  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  40.62 
 
 
161 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  40.62 
 
 
161 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  40 
 
 
161 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  124  8e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
160 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.20146e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  38.75 
 
 
161 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  40.36 
 
 
163 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
162 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  39.75 
 
 
164 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  39.76 
 
 
163 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  118  4e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
160 aa  117  5e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
163 aa  117  8e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  117  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
163 aa  117  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  37.65 
 
 
161 aa  117  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
162 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  115  2e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  115  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  116  2e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  115  2e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 
163 aa  116  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  115  2e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
165 aa  115  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
160 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
160 aa  115  4e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  4e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  114  4e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  4e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  4e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  4e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  4e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>