More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02975 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 427 aa  862    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.98 
 
 		 424 aa  611  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.25 
 
 		 423 aa  557  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0267  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.47 
 
 		 424 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.76 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.2 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.1 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.74 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.13 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.28 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 		 428 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 428 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 429 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  43.53 
 
 		 809 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.1 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.19 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.01 
 
 		 433 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 430 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 		 429 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.6 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  43.87 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.26 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 425 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.03 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 422 aa  349  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 432 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.33 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.71 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  42.79 
 
 		 795 aa  347  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 429 aa  346  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 433 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 		 437 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 432 aa  342  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 426 aa  342  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 427 aa  342  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.76 
 
 		 428 aa  342  9e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.33 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>