123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4356 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  100 
 
 
232 aa  451  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  75.86 
 
 
198 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.34 
 
 
193 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.43 
 
 
182 aa  213  2e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.3 
 
 
187 aa  211  6e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  66.89 
 
 
213 aa  211  8e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.45 
 
 
224 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  66.45 
 
 
224 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.9 
 
 
202 aa  174  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.63 
 
 
204 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.05 
 
 
243 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.05 
 
 
197 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.33 
 
 
154 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
154 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  47.47 
 
 
161 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.34 
 
 
216 aa  145  4e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.9 
 
 
213 aa  145  7e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  54.29 
 
 
155 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.85 
 
 
156 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  48.23 
 
 
148 aa  140  2e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.36 
 
 
148 aa  140  2e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.77 
 
 
153 aa  135  7e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.18 
 
 
151 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.2 
 
 
148 aa  134  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
155 aa  134  1e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.62 
 
 
158 aa  134  1e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.85 
 
 
147 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.89 
 
 
154 aa  131  1e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.44 
 
 
176 aa  127  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.68 
 
 
178 aa  127  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  45.16 
 
 
176 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.43 
 
 
152 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.64 
 
 
157 aa  120  2e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.73 
 
 
208 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  44.93 
 
 
150 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  44.93 
 
 
150 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  47.68 
 
 
176 aa  117  1e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.76 
 
 
246 aa  117  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.86 
 
 
151 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.48 
 
 
152 aa  115  4e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.86 
 
 
151 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.15 
 
 
158 aa  115  8e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.15 
 
 
158 aa  115  8e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.18 
 
 
151 aa  110  1e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.43 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.62 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40 
 
 
983 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.71 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.88 
 
 
1019 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.11 
 
 
980 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.32 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.25 
 
 
1012 aa  84.3  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  32.41 
 
 
997 aa  84.7  1e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.03 
 
 
181 aa  83.2  3e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  29.22 
 
 
253 aa  80.1  3e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  37.04 
 
 
991 aa  79.7  4e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.4 
 
 
223 aa  79.3  5e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.67 
 
 
152 aa  79  6e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 
1011 aa  78.6  8e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 
1011 aa  78.6  8e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.88 
 
 
987 aa  78.2  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.22 
 
 
253 aa  78.2  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.06 
 
 
229 aa  77.4  2e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.34 
 
 
988 aa  76.6  3e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
248 aa  75.9  5e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.62 
 
 
1012 aa  75.9  5e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.24 
 
 
222 aa  75.5  6e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  35.11 
 
 
221 aa  75.1  8e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  27.67 
 
 
1027 aa  71.6  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  28.39 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  28.39 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  28.39 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  28.39 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  28.39 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  28.39 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  28.39 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
235 aa  69.7  4e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
235 aa  69.3  4e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
235 aa  69.7  4e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
235 aa  69.3  5e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
235 aa  67.4  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.67 
 
 
216 aa  67  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.86 
 
 
237 aa  67  3e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
235 aa  65.9  5e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.35 
 
 
988 aa  65.1  9e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.53 
 
 
141 aa  64.3  2e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  28.48 
 
 
200 aa  63.2  4e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.16 
 
 
204 aa  62.4  5e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.03 
 
 
185 aa  62.8  5e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.58 
 
 
153 aa  62.4  7e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.73 
 
 
150 aa  58.9  6e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.5 
 
 
254 aa  57.4  2e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.32 
 
 
208 aa  57.8  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0875  hypothetical protein  53.7 
 
 
87 aa  57.4  2e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0407732  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
235 aa  57.4  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
139 aa  56.2  5e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.47 
 
 
206 aa  53.9  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>