47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3995 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 497 aa  986    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  33.49 
 
 		 507 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  33.49 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.1 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  31.39 
 
 		 506 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  29.84 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  29.37 
 
 		 496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  24.92 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  25.84 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  25.84 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  25.84 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  25.84 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  25.84 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.58 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  20.59 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  20.41 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  19.02 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  19.94 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.43 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  32.17 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 424 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  20.71 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.69 
 
 		 483 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 499 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 497 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  19.39 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.77 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 503 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>