More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1239 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  81.37 
 
 		 205 aa  347  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.55 
 
 		 206 aa  314  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.55 
 
 		 206 aa  314  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.91 
 
 		 206 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.24 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.84 
 
 		 220 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.79 
 
 		 221 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  67.79 
 
 		 221 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  67.96 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  61.27 
 
 		 206 aa  264  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.19 
 
 		 234 aa  258  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.68 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.19 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  60.29 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.71 
 
 		 222 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.22 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.22 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.22 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  60.39 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  60.39 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  60.39 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  60.39 
 
 		 331 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  60.39 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  60.39 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  60.39 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.22 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  61.27 
 
 		 207 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.22 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  55.83 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  50 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.44 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  46.01 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  45.85 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  38.94 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  38.94 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.97 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  39.9 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  34.3 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 		 264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  33.97 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  31.78 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  25.12 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  28.04 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.31 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.69 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.52 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  30.41 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.18 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  30.99 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  30.12 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.97 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.34 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.97 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.13 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 		 232 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.74 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.37 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.37 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.97 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.53 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.53 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.06 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  34.88 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  29.63 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.44 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.53 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.82 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.67 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  32.47 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>