33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0409 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  309  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  59.44 
 
 		 146 aa  167  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  55.24 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  41.1 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  39.85 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  35.06 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  35.06 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  33.33 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  31.65 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  30.94 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  39.45 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  27.97 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  31.21 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  33.1 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  33.9 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  24.48 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  27.33 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  23.08 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.27 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  27.13 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  27.13 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  27.15 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  23.03 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  26.17 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  24.11 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  22.54 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  26.43 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  21.24 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>