74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0945 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  69.75 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  62.57 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  67.5 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  66.88 
 
 		 193 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  66.88 
 
 		 193 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  66.25 
 
 		 193 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  62.71 
 
 		 188 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  66.25 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  64.29 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  59.01 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  55.26 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  55.26 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  55.26 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  54.61 
 
 		 164 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  49.67 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.75 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  47.4 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  47.4 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  47.4 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  46.75 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.1 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.94 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  41.03 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.8 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  35.8 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  38.56 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  35.8 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  39.43 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  39.75 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.56 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  39.63 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  39.63 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.44 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  33.77 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  39.35 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  35.9 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.33 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  34.38 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  34.38 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  32.88 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.46 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  30.19 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.19 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  28.18 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.18 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  28.18 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  27.43 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  28.93 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  28.93 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.93 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  28.93 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.56 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  29.21 
 
 		 248 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.02 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  29.55 
 
 		 235 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  29.55 
 
 		 235 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>