21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3133 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  56.1 
 
 		 412 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  46.83 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  46.48 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  29.17 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  22.13 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  28.89 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  21.19 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  30.57 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  24.43 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  27.57 
 
 		 462 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  24.23 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  22.35 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  23.28 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  23.51 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  23.35 
 
 		 917 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  28.72 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  28.72 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  25.21 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>