33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0028 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0028  patatin  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  87.54 
 
 		 292 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  87.54 
 
 		 292 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  85.25 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  85.25 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  84.34 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  85.25 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  84.89 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  84.04 
 
 		 289 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  84.04 
 
 		 289 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  84.89 
 
 		 288 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  84.17 
 
 		 288 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  67.36 
 
 		 298 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  70.32 
 
 		 297 aa  410  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  69.72 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  69.72 
 
 		 297 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  67.62 
 
 		 303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  41.61 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  38.24 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  25 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  20.52 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  20.52 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  25.71 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  21.2 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  32.97 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2977  Patatin  33.93 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1632  Patatin  28.03 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>