More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2729 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2729  amino acid carrier protein  100 
 
 		 466 aa  920    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.370789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  70.39 
 
 		 469 aa  659    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  57.02 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  58.3 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  55.56 
 
 		 451 aa  488  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  52.38 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  46.52 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  44.28 
 
 		 494 aa  349  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  44.92 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.34 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  42.13 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  41.97 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.34 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.13 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.13 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  42.55 
 
 		 480 aa  338  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  42.55 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  41.91 
 
 		 479 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  41.91 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  41.97 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  42.55 
 
 		 481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  43.41 
 
 		 477 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  41.47 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  40.81 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  41.25 
 
 		 455 aa  333  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41.25 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.25 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  41.7 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41.25 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  40.26 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  41.25 
 
 		 455 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.04 
 
 		 455 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  41.25 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  41.76 
 
 		 476 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  41.97 
 
 		 476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  41.04 
 
 		 455 aa  329  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  41.04 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  41.76 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  40.43 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  41.51 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  42.27 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  41.11 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  42.06 
 
 		 466 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  42.8 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  41.33 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 		 476 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 		 476 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 456 aa  324  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  40.82 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  43.41 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  40.86 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  41.08 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  40.56 
 
 		 504 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  40.56 
 
 		 504 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  41.63 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  42.33 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  40.78 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  40.78 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  39.18 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  41.24 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  40.56 
 
 		 503 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  42.22 
 
 		 445 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  40.65 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  41.15 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  41.45 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  44.42 
 
 		 454 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  40.53 
 
 		 458 aa  315  8e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  40.77 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  41.16 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  39.66 
 
 		 456 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  40.51 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  40.72 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  41.08 
 
 		 478 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  40.72 
 
 		 458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  40.09 
 
 		 459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  40.51 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  40.77 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  42.86 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  42.03 
 
 		 448 aa  313  5.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  40.99 
 
 		 457 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  41.68 
 
 		 450 aa  312  7.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  39.39 
 
 		 498 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  41.03 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  41.57 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  41.81 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  40.56 
 
 		 459 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  39.44 
 
 		 457 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  41.54 
 
 		 459 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  41.59 
 
 		 480 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  40.74 
 
 		 502 aa  309  8e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  40.59 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>