More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1987 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  100 
 
 
198 aa  414  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  55.05 
 
 
227 aa  223  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  52.5 
 
 
201 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  50 
 
 
201 aa  204  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  49.25 
 
 
200 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  51.52 
 
 
199 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  49.74 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  50.51 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  48.74 
 
 
199 aa  197  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  44.95 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  50.26 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  48.48 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  48.99 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  49.74 
 
 
199 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  48.24 
 
 
199 aa  195  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  47.74 
 
 
199 aa  195  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  50.79 
 
 
199 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  47.74 
 
 
199 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  46.73 
 
 
199 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  47.98 
 
 
209 aa  192  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  47.74 
 
 
199 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  47.74 
 
 
199 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  46.73 
 
 
199 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  48.17 
 
 
199 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  46.73 
 
 
198 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  46.91 
 
 
198 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  46.73 
 
 
198 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  47.47 
 
 
201 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  46.23 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  48.21 
 
 
199 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  48.19 
 
 
199 aa  188  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  46.97 
 
 
200 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  48.42 
 
 
229 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  46.97 
 
 
200 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  46.5 
 
 
216 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  45.23 
 
 
200 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  45.23 
 
 
200 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  43.88 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  47.45 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  49.21 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  43.22 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  45.45 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  44.79 
 
 
198 aa  182  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  43.22 
 
 
200 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  45.92 
 
 
199 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0387  Superoxide dismutase  48 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333361  normal  0.539413 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  44.79 
 
 
198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  42.71 
 
 
200 aa  181  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  43.72 
 
 
200 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  46.5 
 
 
200 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  41.24 
 
 
201 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  45.96 
 
 
199 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  44.95 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  45.77 
 
 
206 aa  176  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45.77 
 
 
204 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  45.88 
 
 
200 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  44 
 
 
204 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  43.46 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  45.69 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0493  superoxide dismutase, Fe  43.56 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0535  superoxide dismutase  43.56 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.478108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  45.96 
 
 
193 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  43.15 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  43.3 
 
 
241 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  43.15 
 
 
192 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  44.44 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  44.44 
 
 
193 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  44.44 
 
 
193 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  44.44 
 
 
193 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  44.44 
 
 
193 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  44.5 
 
 
203 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  43.43 
 
 
199 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  42.93 
 
 
199 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  45.69 
 
 
199 aa  168  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  42.79 
 
 
204 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  43.28 
 
 
203 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  45.18 
 
 
194 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  44.9 
 
 
203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  43.22 
 
 
199 aa  165  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  45.08 
 
 
193 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  45.15 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  46.63 
 
 
194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  44.62 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  46.63 
 
 
194 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>