242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0448 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  100 
 
 
307 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  54.69 
 
 
311 aa  336  3e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  55.52 
 
 
317 aa  325  4e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  50.33 
 
 
317 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
317 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  29.78 
 
 
303 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.96 
 
 
303 aa  65.5  1e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  36.26 
 
 
273 aa  63.5  5e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 
310 aa  61.6  1e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  30.57 
 
 
240 aa  62  1e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
332 aa  58.5  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28.95 
 
 
382 aa  57.8  2e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.09 
 
 
232 aa  57.4  3e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.43556e-14  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
242 aa  57.4  3e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  24.28 
 
 
332 aa  57  3e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.61 
 
 
241 aa  57.4  3e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.93 
 
 
244 aa  56.6  5e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.63 
 
 
329 aa  55.8  8e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
242 aa  55.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  55.5  1e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.1  1e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.05917e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.5  1e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.5  1e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.5  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  55.5  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.5  1e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
242 aa  55.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
242 aa  55.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
242 aa  55.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
242 aa  55.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.5  1e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.1  1e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.76 
 
 
298 aa  54.7  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.35 
 
 
239 aa  54.7  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  55.1  2e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.55 
 
 
232 aa  54.7  2e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3209  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
230 aa  53.9  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 
457 aa  53.5  5e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.76 
 
 
252 aa  53.1  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
286 aa  53.1  6e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.23 
 
 
239 aa  52.8  7e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
210 aa  52.8  7e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2960  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
210 aa  52.8  7e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
711 aa  52.8  7e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.35 
 
 
249 aa  52.8  8e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.17 
 
 
248 aa  52.4  8e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 
246 aa  52  1e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.34 
 
 
239 aa  52.4  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
242 aa  52  1e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.78 
 
 
253 aa  51.6  1e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  24.76 
 
 
354 aa  52.4  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.16 
 
 
237 aa  51.2  2e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.73 
 
 
246 aa  51.2  2e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1347  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.98 
 
 
237 aa  51.6  2e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
255 aa  51.2  2e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.02 
 
 
242 aa  51.2  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  23 
 
 
1124 aa  51.2  2e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.16 
 
 
237 aa  51.2  2e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.02 
 
 
242 aa  51.2  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.02 
 
 
242 aa  51.2  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  27.83 
 
 
625 aa  51.6  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.51 
 
 
239 aa  51.2  2e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
214 aa  50.8  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.17 
 
 
238 aa  50.8  3e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.77 
 
 
345 aa  50.4  3e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
234 aa  50.1  4e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.14 
 
 
358 aa  50.4  4e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 
245 aa  50.4  4e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
205 aa  50.1  4e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  27.14 
 
 
297 aa  50.1  5e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.83 
 
 
305 aa  50.1  5e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 
241 aa  50.1  5e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  27.92 
 
 
278 aa  49.7  6e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
278 aa  49.7  6e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.86 
 
 
237 aa  49.7  6e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0959  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.03 
 
 
245 aa  49.3  7e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
237 aa  49.3  7e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
531 aa  49.3  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  22.84 
 
 
317 aa  49.3  8e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0922  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.76 
 
 
245 aa  49.3  8e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512088  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  29.7 
 
 
304 aa  49.3  9e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  8.18174e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  26.47 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0897  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.34 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.7 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.63 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  27.38 
 
 
214 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.89 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  1.29076e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  53.85 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  29.2 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
519 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
1312 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>