40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  100 
 
 		 448 aa  890    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  36.6 
 
 		 421 aa  250  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  38.86 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  36.97 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  35.65 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  35.65 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  33 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  36.26 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  36.07 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  36.54 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  34.62 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  34.62 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  34.38 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  37.14 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  33.18 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  35.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  34.96 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  33.87 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  31.92 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  30.51 
 
 		 415 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  33.83 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  28.8 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.63 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6792  General substrate transporter  25 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  31.98 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>