More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  66.03 
 
 
527 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  69.1 
 
 
527 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  71.46 
 
 
531 aa  754    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  62.78 
 
 
549 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  66.41 
 
 
551 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  70.75 
 
 
534 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  73.04 
 
 
542 aa  745    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  69.4 
 
 
534 aa  738    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  67.36 
 
 
536 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  69.22 
 
 
537 aa  755    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  71.59 
 
 
530 aa  743    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  63.87 
 
 
516 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  66.41 
 
 
531 aa  702    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  63.47 
 
 
516 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  68.81 
 
 
552 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  69.48 
 
 
530 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  68.47 
 
 
543 aa  747    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  67.43 
 
 
541 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  62.93 
 
 
556 aa  678    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62.72 
 
 
550 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  69.17 
 
 
532 aa  743    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  65.07 
 
 
527 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  100 
 
 
529 aa  1069    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  65.41 
 
 
542 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  70.59 
 
 
546 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  72.02 
 
 
529 aa  779    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  65.03 
 
 
527 aa  700    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  68.88 
 
 
540 aa  755    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  62.93 
 
 
556 aa  678    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  70.06 
 
 
529 aa  745    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  63.69 
 
 
542 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  68.27 
 
 
536 aa  729    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  62.93 
 
 
556 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  63.62 
 
 
538 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  69.1 
 
 
527 aa  730    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  70.44 
 
 
526 aa  757    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  70.25 
 
 
524 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  62.74 
 
 
548 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.85 
 
 
522 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  60.46 
 
 
516 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  59.38 
 
 
518 aa  615  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  58.22 
 
 
520 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  58.24 
 
 
531 aa  608  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  61.04 
 
 
513 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  57.47 
 
 
516 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  58.49 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  57.61 
 
 
519 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  58.49 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  58.49 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  58.96 
 
 
510 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  55.36 
 
 
516 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  57.56 
 
 
510 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  57.17 
 
 
523 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  55.91 
 
 
528 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  57.72 
 
 
510 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  58.3 
 
 
510 aa  596  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  58.33 
 
 
510 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  57.56 
 
 
510 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  57.83 
 
 
510 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  59.14 
 
 
519 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  57.17 
 
 
510 aa  594  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  58.87 
 
 
519 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  57.14 
 
 
510 aa  591  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  56.01 
 
 
510 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  57.88 
 
 
510 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  56.3 
 
 
515 aa  588  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  58.87 
 
 
519 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  57.25 
 
 
520 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  55.17 
 
 
516 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  55.9 
 
 
512 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  58.03 
 
 
510 aa  588  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  57.36 
 
 
510 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  57.56 
 
 
510 aa  588  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  56.14 
 
 
516 aa  588  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  56.78 
 
 
531 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  54.2 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  55.04 
 
 
508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  57.36 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  56.29 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  56.2 
 
 
510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  56.59 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  56.98 
 
 
510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  55.6 
 
 
510 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  56.78 
 
 
510 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  56.2 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  56.01 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  56.53 
 
 
508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  56.98 
 
 
510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  55.34 
 
 
515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  55.58 
 
 
522 aa  581  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  56.78 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  56.59 
 
 
510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  56.78 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  57.34 
 
 
514 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  56.13 
 
 
516 aa  578  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  54.55 
 
 
518 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  53.55 
 
 
514 aa  580  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  56.67 
 
 
510 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.73 
 
 
513 aa  579  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  57.23 
 
 
510 aa  578  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>